Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CDO1Q16878 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
CDO1Q16878 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CDO1Q16878 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDO1Q16878 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDO1Q16878 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDO1Q16878 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDO1Q16878 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDO1Q16878 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDO1Q16878 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDO1Q16878 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CDO1Q16878 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDO1Q16878 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CDO1Q16878 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CDO1Q16878 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CDO1Q16878 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CDO1Q16878 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDO1Q16878 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDO1Q16878 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDO1Q16878 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CDO1Q16878 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDO1Q16878 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CDO1Q16878 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CDO1Q16878 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDO1Q16878 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDO1Q16878 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDO1Q16878 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CDO1Q16878 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDO1Q16878 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CDO1Q16878 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CDO1Q16878 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CDO1Q16878 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CDO1Q16878 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDO1Q16878 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CDO1Q16878 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CDO1Q16878 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDO1Q16878 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDO1Q16878 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
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