Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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PTPRNQ16849 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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PTPRNQ16849 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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PTPRNQ16849 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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PTPRNQ16849 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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PTPRNQ16849 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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PTPRNQ16849 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
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PTPRNQ16849 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
PTPRNQ16849 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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PTPRNQ16849 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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PTPRNQ16849 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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