Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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TNXAQ16473 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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TNXAQ16473 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
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TNXAQ16473 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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TNXAQ16473 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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