Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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EFNB3Q15768 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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EFNB3Q15768 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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EFNB3Q15768 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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EFNB3Q15768 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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EFNB3Q15768 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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EFNB3Q15768 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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EFNB3Q15768 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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EFNB3Q15768 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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EFNB3Q15768 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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EFNB3Q15768 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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EFNB3Q15768 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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EFNB3Q15768 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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