Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNHIT3Q15649 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNHIT3Q15649 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNHIT3Q15649 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNHIT3Q15649 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNHIT3Q15649 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNHIT3Q15649 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNHIT3Q15649 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNHIT3Q15649 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNHIT3Q15649 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNHIT3Q15649 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNHIT3Q15649 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNHIT3Q15649 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNHIT3Q15649 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNHIT3Q15649 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNHIT3Q15649 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNHIT3Q15649 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNHIT3Q15649 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNHIT3Q15649 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNHIT3Q15649 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNHIT3Q15649 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNHIT3Q15649 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNHIT3Q15649 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNHIT3Q15649 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNHIT3Q15649 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNHIT3Q15649 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNHIT3Q15649 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNHIT3Q15649 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms