Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRKQ15262 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
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PTPRKQ15262 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
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PTPRKQ15262 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
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PTPRKQ15262 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
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PTPRKQ15262 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
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PTPRKQ15262 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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PTPRKQ15262 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
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PTPRKQ15262 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
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