Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KARSQ15046 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KARSQ15046 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KARSQ15046 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KARSQ15046 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KARSQ15046 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KARSQ15046 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KARSQ15046 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KARSQ15046 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KARSQ15046 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KARSQ15046 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KARSQ15046 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KARSQ15046 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KARSQ15046 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KARSQ15046 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KARSQ15046 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KARSQ15046 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KARSQ15046 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KARSQ15046 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KARSQ15046 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KARSQ15046 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KARSQ15046 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KARSQ15046 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.9 ms