Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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GPNMBQ14956 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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GPNMBQ14956 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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GPNMBQ14956 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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GPNMBQ14956 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
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GPNMBQ14956 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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GPNMBQ14956 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
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GPNMBQ14956 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
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