Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMC1AQ14683 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMC1AQ14683 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMC1AQ14683 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMC1AQ14683 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMC1AQ14683 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMC1AQ14683 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMC1AQ14683 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SMC1AQ14683 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMC1AQ14683 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SMC1AQ14683 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMC1AQ14683 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMC1AQ14683 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMC1AQ14683 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMC1AQ14683 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMC1AQ14683 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMC1AQ14683 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SMC1AQ14683 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMC1AQ14683 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMC1AQ14683 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMC1AQ14683 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SMC1AQ14683 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMC1AQ14683 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMC1AQ14683 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SMC1AQ14683 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMC1AQ14683 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMC1AQ14683 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SMC1AQ14683 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMC1AQ14683 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
SMC1AQ14683 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMC1AQ14683 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMC1AQ14683 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SMC1AQ14683 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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