Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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SEMA3AQ14563 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
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SEMA3AQ14563 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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SEMA3AQ14563 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
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SEMA3AQ14563 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
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SEMA3AQ14563 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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SEMA3AQ14563 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
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SEMA3AQ14563 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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SEMA3AQ14563 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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SEMA3AQ14563 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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