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| SEMA3A | Q14563 | RNU6-1137P-201 | ENST00000517073 | 99 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNA5SP290-201 | ENST00000517133 | 127 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL137161.1-201 | ENST00000532231 | 390 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | APOOP3-201 | ENST00000536787 | 586 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC00508-201 | ENST00000538901 | 194 nt | TSL 5 BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC004024.1-201 | ENST00000549244 | 247 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | AC090132.2-201 | ENST00000615881 | 347 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | uc_338.34-201 | ENST00000617467 | 174 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC00890-202 | ENST00000569275 | 4595 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC017071.1-201 | ENST00000564407 | 2204 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC093725.1-201 | ENST00000508135 | 2672 nt | TSL 5 BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | OR51L1-203 | ENST00000641819 | 7300 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PTBP2-211 | ENST00000609116 | 12014 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MANEA-201 | ENST00000358812 | 4575 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AP003122.5-201 | ENST00000527668 | 3766 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | C5orf46-201 | ENST00000318315 | 506 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU1-70P-201 | ENST00000362618 | 164 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-1252P-201 | ENST00000363054 | 104 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | DYNLT3P1-201 | ENST00000378574 | 347 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR301A-201 | ENST00000385261 | 86 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNY4P36-201 | ENST00000391116 | 96 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | RNA5SP31-201 | ENST00000411144 | 127 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC01737-201 | ENST00000412647 | 403 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | AL591704.1-201 | ENST00000432574 | 275 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PIGFP3-201 | ENST00000441918 | 722 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | TRAPPC2P3-201 | ENST00000443200 | 321 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL139383.1-203 | ENST00000445227 | 420 nt | TSL 3 BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC104058.1-201 | ENST00000448028 | 297 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC025918.1-201 | ENST00000452467 | 383 nt | TSL 3 BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL445465.2-201 | ENST00000455530 | 461 nt | TSL 2 BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL031183.1-201 | ENST00000457667 | 207 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC012081.1-201 | ENST00000462382 | 477 nt | TSL 3 BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC008155.2-201 | ENST00000464337 | 397 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC106892.1-201 | ENST00000491608 | 406 nt | TSL 3 BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MGC32805-203 | ENST00000506053 | 652 nt | TSL 3 BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC025244.2-201 | ENST00000509215 | 422 nt | TSL 3 BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC098591.2-201 | ENST00000510152 | 315 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | APOOP4-201 | ENST00000513530 | 597 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-864P-201 | ENST00000516256 | 108 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.682-201 | ENST00000516457 | 100 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU4ATAC3P-201 | ENST00000516699 | 126 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC090138.1-201 | ENST00000524493 | 578 nt | TSL 4 BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MDM2-233 | ENST00000545204 | 398 nt | TSL 5 BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC011933.3-201 | ENST00000578226 | 372 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC098617.1-215 | ENST00000594798 | 1152 nt | TSL 5 BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC098826.3-201 | ENST00000603823 | 466 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | NUTF2P8-201 | ENST00000604593 | 363 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | HSPE1P7-201 | ENST00000604681 | 321 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC016925.2-201 | ENST00000605108 | 242 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6ATAC35P-201 | ENST00000609276 | 444 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | HTN1-205 | ENST00000610341 | 536 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | DUSP12P1-201 | ENST00000612874 | 516 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC01378-205 | ENST00000615833 | 158 nt | TSL 5 BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SMAD5-AS1_2.1-201 | ENST00000617906 | 131 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PHF6-201 | ENST00000332070 | 4759 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.88 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MTCO1P12-201 | ENST00000414273 | 1543 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.88 | | |
| SEMA3A | Q14563 | TAS2R13-201 | ENST00000390677 | 1637 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MTND5P27-201 | ENST00000428871 | 1720 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| SEMA3A | Q14563 | N4BP2L2-211 | ENST00000504114 | 2513 nt | TSL 5 BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| SEMA3A | Q14563 | DST-204 | ENST00000361203 | 22431 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.445-201 | ENST00000384168 | 102 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-1297P-201 | ENST00000384415 | 104 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNA5SP252-201 | ENST00000391131 | 119 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ATP2B2-IT2-201 | ENST00000419591 | 507 nt | TSL 2 BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| SEMA3A | Q14563 | IPO7P1-201 | ENST00000442031 | 636 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU7-152P-201 | ENST00000458982 | 64 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| SEMA3A | Q14563 | snoU13.22-201 | ENST00000459428 | 104 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-1208P-201 | ENST00000459588 | 107 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC130509.1-201 | ENST00000464158 | 433 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPL7P43-201 | ENST00000478876 | 753 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC090096.1-201 | ENST00000489168 | 390 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC093663.1-201 | ENST00000497190 | 394 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| SEMA3A | Q14563 | FCF1P8-201 | ENST00000510322 | 597 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LIAS-206 | ENST00000513731 | 826 nt | TSL 5 BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-1170P-201 | ENST00000515974 | 106 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC103957.1-201 | ENST00000517681 | 503 nt | TSL 3 BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AP000873.2-206 | ENST00000529811 | 429 nt | TSL 2 BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC090592.1-203 | ENST00000533942 | 575 nt | TSL 3 BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC026765.1-201 | ENST00000547876 | 435 nt | TSL 3 BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC092120.1-201 | ENST00000562211 | 420 nt | TSL 3 BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR4444-1-201 | ENST00000581696 | 74 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR3609-201 | ENST00000582661 | 80 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR4444-2-201 | ENST00000584390 | 74 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC02210-208 | ENST00000585118 | 546 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC005357.2-201 | ENST00000586473 | 583 nt | TSL 2 BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC01897-203 | ENST00000591503 | 369 nt | TSL 2 BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC022017.1-201 | ENST00000608793 | 559 nt | TSL 4 BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC019193.3-201 | ENST00000609144 | 554 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |