Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms