Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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UBE4AQ14139 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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UBE4AQ14139 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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UBE4AQ14139 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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UBE4AQ14139 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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UBE4AQ14139 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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UBE4AQ14139 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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