Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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