Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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TCOF1Q13428 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
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TCOF1Q13428 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
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TCOF1Q13428 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
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TCOF1Q13428 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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TCOF1Q13428 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
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TCOF1Q13428 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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