Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC1.74□□□□□ -2.13
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ERCC8Q13216 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
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ERCC8Q13216 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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ERCC8Q13216 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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ERCC8Q13216 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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