Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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TRAF3Q13114 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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TRAF3Q13114 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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TRAF3Q13114 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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TRAF3Q13114 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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TRAF3Q13114 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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