Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms