Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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USP18Q9UMW8 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
USP18Q9UMW8 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
USP18Q9UMW8 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
USP18Q9UMW8 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
USP18Q9UMW8 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
USP18Q9UMW8 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
USP18Q9UMW8 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
USP18Q9UMW8 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
USP18Q9UMW8 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
USP18Q9UMW8 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
USP18Q9UMW8 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
USP18Q9UMW8 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
USP18Q9UMW8 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
USP18Q9UMW8 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
USP18Q9UMW8 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
USP18Q9UMW8 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
USP18Q9UMW8 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
USP18Q9UMW8 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
USP18Q9UMW8 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
USP18Q9UMW8 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
USP18Q9UMW8 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
USP18Q9UMW8 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
USP18Q9UMW8 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
USP18Q9UMW8 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
USP18Q9UMW8 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
USP18Q9UMW8 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
USP18Q9UMW8 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
USP18Q9UMW8 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
USP18Q9UMW8 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
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