Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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