Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
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HOXD1Q9GZZ0 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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