Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
RBM42Q9BTD8 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
RBM42Q9BTD8 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
RBM42Q9BTD8 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
RBM42Q9BTD8 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
RBM42Q9BTD8 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
RBM42Q9BTD8 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
RBM42Q9BTD8 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
RBM42Q9BTD8 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
RBM42Q9BTD8 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
RBM42Q9BTD8 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
RBM42Q9BTD8 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
RBM42Q9BTD8 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
RBM42Q9BTD8 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
RBM42Q9BTD8 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
RBM42Q9BTD8 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
RBM42Q9BTD8 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
RBM42Q9BTD8 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
RBM42Q9BTD8 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
RBM42Q9BTD8 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
RBM42Q9BTD8 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
RBM42Q9BTD8 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
RBM42Q9BTD8 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
RBM42Q9BTD8 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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