Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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MEIS3Q99687 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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MEIS3Q99687 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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MEIS3Q99687 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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MEIS3Q99687 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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MEIS3Q99687 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
MEIS3Q99687 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
MEIS3Q99687 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
MEIS3Q99687 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MEIS3Q99687 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MEIS3Q99687 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MEIS3Q99687 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MEIS3Q99687 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MEIS3Q99687 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MEIS3Q99687 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MEIS3Q99687 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MEIS3Q99687 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MEIS3Q99687 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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