Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SNX29Q8TEQ0 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms