Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHCHD4Q8N4Q1 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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CHCHD4Q8N4Q1 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
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CHCHD4Q8N4Q1 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
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CHCHD4Q8N4Q1 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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