Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C9orf135Q5VTT2 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms