Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

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Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.06□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC0.05□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LAMA3Q16787 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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