Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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HIF1AQ16665 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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HIF1AQ16665 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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HIF1AQ16665 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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HIF1AQ16665 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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