Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FXNQ16595 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FXNQ16595 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FXNQ16595 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FXNQ16595 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FXNQ16595 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FXNQ16595 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FXNQ16595 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FXNQ16595 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FXNQ16595 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FXNQ16595 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FXNQ16595 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FXNQ16595 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FXNQ16595 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FXNQ16595 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
FXNQ16595 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FXNQ16595 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FXNQ16595 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FXNQ16595 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FXNQ16595 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FXNQ16595 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FXNQ16595 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FXNQ16595 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FXNQ16595 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FXNQ16595 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
FXNQ16595 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
FXNQ16595 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FXNQ16595 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FXNQ16595 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
FXNQ16595 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FXNQ16595 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
FXNQ16595 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
FXNQ16595 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
FXNQ16595 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FXNQ16595 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
FXNQ16595 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
FXNQ16595 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
FXNQ16595 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FXNQ16595 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
FXNQ16595 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FXNQ16595 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms