Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPAQ15257 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.8 ms