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| BRD3 | Q15059 | Z98742.2-201 | ENST00000431564 | 187 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC130469.1-201 | ENST00000597256 | 388 nt | TSL 5 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AL596220.1-201 | ENST00000622121 | 542 nt | TSL 4 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | Z69720.2-201 | ENST00000624755 | 279 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC019117.3-201 | ENST00000637807 | 3523 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | CHD9-218 | ENST00000566029 | 13110 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | RASA1-202 | ENST00000456692 | 3776 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL133475.1-201 | ENST00000404414 | 305 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC010731.3-201 | ENST00000415029 | 566 nt | TSL 4 BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL355303.1-201 | ENST00000428920 | 680 nt | TSL 3 BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | MICF-203 | ENST00000432679 | 129 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | HMGB1P31-201 | ENST00000437242 | 427 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | VN1R34P-201 | ENST00000447387 | 883 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPL21P10-201 | ENST00000463521 | 490 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | DYNLL1P5-201 | ENST00000467158 | 270 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | RN7SL293P-201 | ENST00000481765 | 281 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC016556.1-201 | ENST00000510004 | 935 nt | TSL 2 BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
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| BRD3 | Q15059 | RNU6-1281P-201 | ENST00000516223 | 105 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC078962.4-201 | ENST00000546135 | 254 nt | TSL 3 BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC002044.1-201 | ENST00000606707 | 158 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | RMST_7.1-201 | ENST00000621935 | 268 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR7157-201 | ENST00000635801 | 60 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR3529-201 | ENST00000637713 | 78 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | COPS2-203 | ENST00000542928 | 1580 nt | TSL 2 BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | SLCO1B3-201 | ENST00000261196 | 2840 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | SNX10-209 | ENST00000619420 | 2361 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | FOXP2-211 | ENST00000408937 | 6443 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | KIAA1107-202 | ENST00000636278 | 4065 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | ZFYVE16-202 | ENST00000505560 | 6599 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | MTCO1P12-201 | ENST00000414273 | 1543 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | MACC1-205 | ENST00000589011 | 2686 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-483P-201 | ENST00000384088 | 108 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | SNORD116-20-201 | ENST00000384529 | 92 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR23B-201 | ENST00000384832 | 97 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC073626.1-201 | ENST00000415146 | 582 nt | TSL 4 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | NAALADL2-AS1-201 | ENST00000426315 | 804 nt | TSL 5 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL365400.1-201 | ENST00000431854 | 640 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | KCNJ6-AS1-201 | ENST00000435001 | 357 nt | TSL 5 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL117341.1-201 | ENST00000437213 | 373 nt | TSL 5 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | ATP5C1P1-201 | ENST00000441945 | 895 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL845311.1-201 | ENST00000444791 | 891 nt | TSL 3 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | DNM3-IT1-201 | ENST00000450800 | 396 nt | TSL 3 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | snoU13.22-201 | ENST00000459428 | 104 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPL21P93-201 | ENST00000480465 | 489 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC068205.1-204 | ENST00000532989 | 481 nt | TSL 3 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | CR383656.8-201 | ENST00000549046 | 145 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR3616-201 | ENST00000584070 | 92 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |