Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms