Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.02
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CHD4Q14839 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
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CHD4Q14839 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
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CHD4Q14839 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
CHD4Q14839 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
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CHD4Q14839 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
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CHD4Q14839 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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