Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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PDE7AQ13946 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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PDE7AQ13946 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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PDE7AQ13946 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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PDE7AQ13946 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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PDE7AQ13946 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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PDE7AQ13946 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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PDE7AQ13946 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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PDE7AQ13946 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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PDE7AQ13946 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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