Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms