Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms