Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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