Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.6 ms