Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
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