Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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TUBB3Q13509 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
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TUBB3Q13509 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
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TUBB3Q13509 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
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TUBB3Q13509 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
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TUBB3Q13509 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
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TUBB3Q13509 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
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TUBB3Q13509 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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TUBB3Q13509 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
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TUBB3Q13509 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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