Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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