Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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