Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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