Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ITGB3BPQ13352 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ITGB3BPQ13352 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ITGB3BPQ13352 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ITGB3BPQ13352 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ITGB3BPQ13352 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ITGB3BPQ13352 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
ITGB3BPQ13352 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
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ITGB3BPQ13352 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGB3BPQ13352 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGB3BPQ13352 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGB3BPQ13352 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGB3BPQ13352 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGB3BPQ13352 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGB3BPQ13352 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGB3BPQ13352 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGB3BPQ13352 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGB3BPQ13352 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGB3BPQ13352 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGB3BPQ13352 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGB3BPQ13352 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGB3BPQ13352 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGB3BPQ13352 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGB3BPQ13352 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGB3BPQ13352 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGB3BPQ13352 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGB3BPQ13352 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGB3BPQ13352 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGB3BPQ13352 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGB3BPQ13352 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGB3BPQ13352 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGB3BPQ13352 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGB3BPQ13352 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
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ITGB3BPQ13352 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
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ITGB3BPQ13352 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
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ITGB3BPQ13352 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ITGB3BPQ13352 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
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