Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATMQ13315 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATMQ13315 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATMQ13315 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATMQ13315 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATMQ13315 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATMQ13315 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATMQ13315 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATMQ13315 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATMQ13315 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATMQ13315 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATMQ13315 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATMQ13315 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATMQ13315 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATMQ13315 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATMQ13315 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATMQ13315 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATMQ13315 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATMQ13315 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATMQ13315 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATMQ13315 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATMQ13315 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATMQ13315 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATMQ13315 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATMQ13315 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATMQ13315 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATMQ13315 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATMQ13315 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATMQ13315 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATMQ13315 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATMQ13315 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATMQ13315 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATMQ13315 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATMQ13315 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATMQ13315 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATMQ13315 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATMQ13315 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATMQ13315 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATMQ13315 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATMQ13315 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATMQ13315 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATMQ13315 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATMQ13315 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATMQ13315 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATMQ13315 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATMQ13315 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATMQ13315 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATMQ13315 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATMQ13315 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATMQ13315 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATMQ13315 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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