Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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