Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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IFT88Q13099 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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IFT88Q13099 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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IFT88Q13099 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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IFT88Q13099 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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IFT88Q13099 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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IFT88Q13099 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
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IFT88Q13099 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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IFT88Q13099 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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