Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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