Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC0.27□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC0.26□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.25□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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