Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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SH3BP4Q9P0V3 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
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SH3BP4Q9P0V3 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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SH3BP4Q9P0V3 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
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SH3BP4Q9P0V3 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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SH3BP4Q9P0V3 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
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SH3BP4Q9P0V3 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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