Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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GGA3Q9NZ52 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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GGA3Q9NZ52 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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GGA3Q9NZ52 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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GGA3Q9NZ52 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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GGA3Q9NZ52 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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GGA3Q9NZ52 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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GGA3Q9NZ52 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GGA3Q9NZ52 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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