Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 971.9 ms